MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 chromosome

Total Repeats: 82302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009428	GA	3	6	17	22	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009428	AAG	2	6	72	77	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276059
3	NC_009428	CGC	2	6	101	106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276059
4	NC_009428	CCG	2	6	119	124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276059
5	NC_009428	CGG	2	6	181	186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276059
6	NC_009428	GCC	4	12	189	200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276059
7	NC_009428	TCC	2	6	247	252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276059
8	NC_009428	CGC	2	6	317	322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276059
9	NC_009428	G	6	6	538	543	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009428	CTG	2	6	572	577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009428	GCC	2	6	584	589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009428	GCG	2	6	594	599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009428	TCC	2	6	610	615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_009428	G	6	6	740	745	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009428	GC	3	6	752	757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009428	ACA	2	6	796	801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009428	CG	3	6	812	817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009428	GCT	2	6	901	906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276060
19	NC_009428	CGA	2	6	967	972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276060
20	NC_009428	TGGCG	2	10	973	982	0 %	20 %	60 %	20 %	146276060
21	NC_009428	TTC	2	6	1004	1009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276060
22	NC_009428	CGCCTG	2	12	1046	1057	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	146276060
23	NC_009428	CGC	2	6	1107	1112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276060
24	NC_009428	CGC	2	6	1116	1121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276060
25	NC_009428	AGG	2	6	1125	1130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276060
26	NC_009428	GCCC	2	8	1160	1167	0 %	0 %	25 %	75 %	146276060
27	NC_009428	TCG	3	9	1230	1238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276060
28	NC_009428	GCC	3	9	1262	1270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276060
29	NC_009428	CGC	2	6	1271	1276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276060
30	NC_009428	G	6	6	1286	1291	0 %	0 %	100 %	0 %	146276060
31	NC_009428	GGC	2	6	1322	1327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276060
32	NC_009428	TGGGC	2	10	1330	1339	0 %	20 %	60 %	20 %	146276060
33	NC_009428	GC	3	6	1392	1397	0 %	0 %	50 %	50 %	146276060
34	NC_009428	GCGCGA	2	12	1450	1461	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146276060
35	NC_009428	GAT	2	6	1511	1516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276060
36	NC_009428	AGG	2	6	1548	1553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276060
37	NC_009428	TTC	2	6	1556	1561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276060
38	NC_009428	GAG	2	6	1643	1648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276060
39	NC_009428	GCC	2	6	1659	1664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276060
40	NC_009428	GTG	2	6	1679	1684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276060
41	NC_009428	CCGA	2	8	1694	1701	25 %	0 %	25 %	50 %	146276060
42	NC_009428	GCA	2	6	1726	1731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276060
43	NC_009428	GAG	2	6	1952	1957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276060
44	NC_009428	ACA	2	6	1983	1988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146276060
45	NC_009428	CGCC	2	8	2032	2039	0 %	0 %	25 %	75 %	146276060
46	NC_009428	CGCT	2	8	2081	2088	0 %	25 %	25 %	50 %	146276060
47	NC_009428	CGG	2	6	2110	2115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276060
48	NC_009428	ACCAC	2	10	2121	2130	40 %	0 %	0 %	60 %	146276060
49	NC_009428	CATG	2	8	2134	2141	25 %	25 %	25 %	25 %	146276060
50	NC_009428	GAG	2	6	2156	2161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276060
51	NC_009428	GAC	2	6	2189	2194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276060
52	NC_009428	GCC	2	6	2208	2213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276060
53	NC_009428	TGC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276060
54	NC_009428	C	6	6	2253	2258	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
55	NC_009428	CCAT	2	8	2264	2271	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009428	AAG	2	6	2328	2333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009428	GCG	2	6	2363	2368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276061
58	NC_009428	GTCG	2	8	2397	2404	0 %	25 %	50 %	25 %	146276061
59	NC_009428	GCG	2	6	2409	2414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276061
60	NC_009428	GGT	2	6	2499	2504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276061
61	NC_009428	GGT	2	6	2520	2525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276061
62	NC_009428	CGA	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276061
63	NC_009428	CGG	2	6	2552	2557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276061
64	NC_009428	TGC	2	6	2561	2566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276061
65	NC_009428	GC	3	6	2594	2599	0 %	0 %	50 %	50 %	146276061
66	NC_009428	TGACGG	2	12	2636	2647	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146276061
67	NC_009428	CCGG	2	8	2648	2655	0 %	0 %	50 %	50 %	146276061
68	NC_009428	GGA	2	6	2685	2690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276061
69	NC_009428	TGC	2	6	2747	2752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276061
70	NC_009428	GAG	2	6	2791	2796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276061
71	NC_009428	CATG	2	8	2823	2830	25 %	25 %	25 %	25 %	146276061
72	NC_009428	GAG	2	6	2842	2847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276061
73	NC_009428	TGC	2	6	2855	2860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276061
74	NC_009428	CGAC	2	8	2870	2877	25 %	0 %	25 %	50 %	146276061
75	NC_009428	CG	3	6	2889	2894	0 %	0 %	50 %	50 %	146276061
76	NC_009428	GAAC	2	8	2961	2968	50 %	0 %	25 %	25 %	146276061
77	NC_009428	CTC	2	6	2977	2982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276061
78	NC_009428	GAC	3	9	2983	2991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276061
79	NC_009428	CGC	2	6	3041	3046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276061
80	NC_009428	CG	3	6	3095	3100	0 %	0 %	50 %	50 %	146276061
81	NC_009428	GCG	2	6	3120	3125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276061
82	NC_009428	CGA	2	6	3216	3221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276061
83	NC_009428	GAG	2	6	3268	3273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276061
84	NC_009428	CGA	2	6	3294	3299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276061
85	NC_009428	TCG	2	6	3385	3390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276061
86	NC_009428	CGG	2	6	3428	3433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276061
87	NC_009428	GTC	2	6	3439	3444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276061
88	NC_009428	CT	3	6	3558	3563	0 %	50 %	0 %	50 %	146276062
89	NC_009428	CG	3	6	3581	3586	0 %	0 %	50 %	50 %	146276062
90	NC_009428	GGC	2	6	3606	3611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
91	NC_009428	GGGC	2	8	3636	3643	0 %	0 %	75 %	25 %	146276062
92	NC_009428	GCT	2	6	3670	3675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276062
93	NC_009428	CGGG	2	8	3682	3689	0 %	0 %	75 %	25 %	146276062
94	NC_009428	GCG	2	6	3694	3699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
95	NC_009428	CG	3	6	3698	3703	0 %	0 %	50 %	50 %	146276062
96	NC_009428	CGA	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276062
97	NC_009428	CG	3	6	3718	3723	0 %	0 %	50 %	50 %	146276062
98	NC_009428	GCC	3	9	3752	3760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276062
99	NC_009428	GCG	2	6	3807	3812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
100	NC_009428	GGC	2	6	3864	3869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
101	NC_009428	CTGG	2	8	3883	3890	0 %	25 %	50 %	25 %	146276062
102	NC_009428	GGC	2	6	3919	3924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
103	NC_009428	CGG	3	9	3932	3940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
104	NC_009428	GCG	2	6	4064	4069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
105	NC_009428	CG	3	6	4093	4098	0 %	0 %	50 %	50 %	146276062
106	NC_009428	GGC	2	6	4120	4125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
107	NC_009428	GGC	2	6	4141	4146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
108	NC_009428	GGC	2	6	4153	4158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
109	NC_009428	GTCG	2	8	4186	4193	0 %	25 %	50 %	25 %	146276062
110	NC_009428	GGA	2	6	4198	4203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276062
111	NC_009428	GCG	3	9	4237	4245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
112	NC_009428	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
113	NC_009428	GCT	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276062
114	NC_009428	GC	4	8	4387	4394	0 %	0 %	50 %	50 %	146276062
115	NC_009428	GCG	2	6	4412	4417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
116	NC_009428	CTG	2	6	4424	4429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276062
117	NC_009428	CGA	2	6	4432	4437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276062
118	NC_009428	GGC	2	6	4441	4446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
119	NC_009428	GGC	2	6	4468	4473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276062
120	NC_009428	CGA	2	6	4480	4485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276062
121	NC_009428	GC	3	6	4491	4496	0 %	0 %	50 %	50 %	146276062
122	NC_009428	G	6	6	4550	4555	0 %	0 %	100 %	0 %	146276062
123	NC_009428	TCA	2	6	4640	4645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276063
124	NC_009428	TGGGCG	2	12	4649	4660	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	146276063
125	NC_009428	GGC	2	6	4665	4670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276063
126	NC_009428	GGCTG	2	10	4691	4700	0 %	20 %	60 %	20 %	146276063
127	NC_009428	AGC	2	6	4703	4708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276063
128	NC_009428	AGG	2	6	4718	4723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276063
129	NC_009428	CTT	2	6	4731	4736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276063
130	NC_009428	GCGCT	2	10	4772	4781	0 %	20 %	40 %	40 %	146276063
131	NC_009428	GGC	2	6	4796	4801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276063
132	NC_009428	CGGGA	2	10	4815	4824	20 %	0 %	60 %	20 %	146276063
133	NC_009428	TCT	2	6	4928	4933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276063
134	NC_009428	GGT	2	6	4936	4941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276063
135	NC_009428	CGG	2	6	5041	5046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009428	CG	3	6	5104	5109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009428	CAAAG	2	10	5110	5119	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009428	CCA	2	6	5256	5261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276064
139	NC_009428	GGT	2	6	5274	5279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276064
140	NC_009428	CGA	2	6	5292	5297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276064
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143	NC_009428	CGG	2	6	5414	5419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276064
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147	NC_009428	CGC	2	6	5661	5666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276064
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149	NC_009428	TCA	2	6	5897	5902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276064
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160	NC_009428	CGG	2	6	6212	6217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276064
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252	NC_009428	TCC	2	6	9849	9854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276067
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269	NC_009428	GGC	2	6	10661	10666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276067
270	NC_009428	ACC	2	6	10713	10718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276067
271	NC_009428	GAAG	2	8	10796	10803	50 %	0 %	50 %	0 %	146276067
272	NC_009428	CGG	2	6	10840	10845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276067
273	NC_009428	GCC	2	6	10950	10955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276067
274	NC_009428	CGC	2	6	11002	11007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
275	NC_009428	TCC	2	6	11010	11015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
276	NC_009428	CGA	2	6	11060	11065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276068
277	NC_009428	CAAGGA	2	12	11135	11146	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	146276068
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280	NC_009428	GCT	2	6	11216	11221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276068
281	NC_009428	GCC	2	6	11226	11231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276068
282	NC_009428	CGTGAT	2	12	11306	11317	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146276068
283	NC_009428	CAC	2	6	11342	11347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276068
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291	NC_009428	TCA	2	6	11635	11640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276068
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293	NC_009428	ATC	2	6	11721	11726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276068
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299	NC_009428	CGG	2	6	11995	12000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276068
300	NC_009428	CGA	2	6	12071	12076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276068
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345	NC_009428	CG	3	6	13724	13729	0 %	0 %	50 %	50 %	146276070
346	NC_009428	TC	3	6	13737	13742	0 %	50 %	0 %	50 %	146276070
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350	NC_009428	AGA	2	6	13940	13945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276070
351	NC_009428	CG	4	8	13955	13962	0 %	0 %	50 %	50 %	146276070
352	NC_009428	ATG	2	6	13969	13974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276070
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362	NC_009428	GC	3	6	14314	14319	0 %	0 %	50 %	50 %	146276070
363	NC_009428	GC	3	6	14336	14341	0 %	0 %	50 %	50 %	146276070
364	NC_009428	CGGC	2	8	14349	14356	0 %	0 %	50 %	50 %	146276070
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371	NC_009428	CG	3	6	14647	14652	0 %	0 %	50 %	50 %	146276070
372	NC_009428	CGG	3	9	14670	14678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276070
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380	NC_009428	CGG	2	6	14993	14998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276071
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382	NC_009428	GGC	2	6	15050	15055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276071
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384	NC_009428	GCCC	2	8	15152	15159	0 %	0 %	25 %	75 %	146276071
385	NC_009428	GCG	3	9	15267	15275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276071
386	NC_009428	GC	3	6	15339	15344	0 %	0 %	50 %	50 %	146276071
387	NC_009428	CGC	2	6	15375	15380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276071
388	NC_009428	C	6	6	15434	15439	0 %	0 %	0 %	100 %	146276071
389	NC_009428	GCCC	2	8	15462	15469	0 %	0 %	25 %	75 %	146276071
390	NC_009428	GCA	2	6	15471	15476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276071
391	NC_009428	CG	5	10	15579	15588	0 %	0 %	50 %	50 %	146276071
392	NC_009428	CGC	2	6	15594	15599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276071
393	NC_009428	GTC	2	6	15652	15657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276071
394	NC_009428	AGC	2	6	15659	15664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276071
395	NC_009428	TCG	2	6	15686	15691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276071
396	NC_009428	GAG	2	6	15718	15723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276071
397	NC_009428	GCC	2	6	15768	15773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276071
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399	NC_009428	CCGA	2	8	15797	15804	25 %	0 %	25 %	50 %	146276071
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